Nel 1936 Paolo Pestrin nasce a San Giorgio di Nogaro (Udine). Il Genoa lo preleva giovanissimo dalla San Giorgina e lo fa esordire in prima squadra proprio a Udine il 16 maggio 1954, nella prima delle due uniche partite da lui disputate in quel campionato.
E’ un motore instancabile di centrocampo e l’annata successiva entra definitivamente tra i titolari giocando 32 partite (sulle 34 disponibili) e segnando un’unica rete (a Napoli il 6 febbraio 1955).
Nel torneo successivo migliora il numero delle marcature: ne realizza 6 di cui la prima contro il Milan battuto a Marassi per 3-1, su un totale di 28 presenze.
Conclusa l’avventura in maglia rossoblu, viene acquistato dalla Roma, dove trascorrerà ben 7 stagioni, con 3 presenze nella Nazionale giovanile e 4 in Nazionale B, contribuendo alla vittoria finale dei giallorossi nella Coppa delle Fiere 1960-61.